MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 1182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	A	6	6	15	20	100 %	0 %	0 %	0 %	414073193
2	NC_019430	GT	3	6	46	51	0 %	50 %	50 %	0 %	414073193
3	NC_019430	GAAA	2	8	57	64	75 %	0 %	25 %	0 %	414073193
4	NC_019430	TTG	2	6	80	85	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073193
5	NC_019430	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073193
6	NC_019430	GAC	2	6	238	243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073193
7	NC_019430	AAG	2	6	266	271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073193
8	NC_019430	T	7	7	297	303	0 %	100 %	0 %	0 %	414073193
9	NC_019430	GAA	2	6	313	318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073193
10	NC_019430	GAA	2	6	438	443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073193
11	NC_019430	ATT	2	6	499	504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073193
12	NC_019430	AGA	2	6	582	587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073193
13	NC_019430	A	7	7	684	690	100 %	0 %	0 %	0 %	414073193
14	NC_019430	AGA	2	6	696	701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073193
15	NC_019430	A	6	6	745	750	100 %	0 %	0 %	0 %	414073193
16	NC_019430	AGA	2	6	822	827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073193
17	NC_019430	A	6	6	847	852	100 %	0 %	0 %	0 %	414073193
18	NC_019430	AGA	2	6	858	863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073193
19	NC_019430	GAA	2	6	868	873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073193
20	NC_019430	TGT	2	6	929	934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073193
21	NC_019430	AGAC	2	8	1014	1021	50 %	0 %	25 %	25 %	414073193
22	NC_019430	AGCA	2	8	1063	1070	50 %	0 %	25 %	25 %	414073193
23	NC_019430	A	6	6	1108	1113	100 %	0 %	0 %	0 %	414073193
24	NC_019430	TACC	2	8	1126	1133	25 %	25 %	0 %	50 %	414073193
25	NC_019430	A	7	7	1307	1313	100 %	0 %	0 %	0 %	414073194
26	NC_019430	AAT	2	6	1320	1325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073194
27	NC_019430	T	8	8	1334	1341	0 %	100 %	0 %	0 %	414073194
28	NC_019430	TTTA	2	8	1360	1367	25 %	75 %	0 %	0 %	414073194
29	NC_019430	CTGTT	2	10	1393	1402	0 %	60 %	20 %	20 %	414073194
30	NC_019430	TCA	2	6	1403	1408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073194
31	NC_019430	AATT	2	8	1459	1466	50 %	50 %	0 %	0 %	414073194
32	NC_019430	T	7	7	1477	1483	0 %	100 %	0 %	0 %	414073194
33	NC_019430	ATT	2	6	1504	1509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073194
34	NC_019430	TCTT	2	8	1558	1565	0 %	75 %	0 %	25 %	414073194
35	NC_019430	GTT	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073194
36	NC_019430	T	7	7	1624	1630	0 %	100 %	0 %	0 %	414073194
37	NC_019430	TGAT	2	8	1646	1653	25 %	50 %	25 %	0 %	414073194
38	NC_019430	T	6	6	1690	1695	0 %	100 %	0 %	0 %	414073194
39	NC_019430	ATTTTC	2	12	1734	1745	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	414073195
40	NC_019430	TTG	2	6	1764	1769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073195
41	NC_019430	T	6	6	1780	1785	0 %	100 %	0 %	0 %	414073195
42	NC_019430	T	6	6	1812	1817	0 %	100 %	0 %	0 %	414073195
43	NC_019430	ATCTT	2	10	1819	1828	20 %	60 %	0 %	20 %	414073195
44	NC_019430	AGAAAT	2	12	1842	1853	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	414073195
45	NC_019430	TTC	2	6	1872	1877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073195
46	NC_019430	TGT	2	6	1906	1911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073195
47	NC_019430	TCT	2	6	1939	1944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073195
48	NC_019430	T	7	7	1982	1988	0 %	100 %	0 %	0 %	414073195
49	NC_019430	TAA	2	6	2352	2357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073196
50	NC_019430	TTTTA	2	10	2394	2403	20 %	80 %	0 %	0 %	414073196
51	NC_019430	A	6	6	2462	2467	100 %	0 %	0 %	0 %	414073196
52	NC_019430	A	6	6	2478	2483	100 %	0 %	0 %	0 %	414073196
53	NC_019430	ATTTT	2	10	2501	2510	20 %	80 %	0 %	0 %	414073196
54	NC_019430	GAA	3	9	2533	2541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073196
55	NC_019430	AAG	2	6	2543	2548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073196
56	NC_019430	ATT	2	6	2561	2566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073196
57	NC_019430	CATGG	2	10	2587	2596	20 %	20 %	40 %	20 %	414073196
58	NC_019430	ACA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073196
59	NC_019430	A	8	8	2699	2706	100 %	0 %	0 %	0 %	414073196
60	NC_019430	ATG	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073196
61	NC_019430	AAAGA	2	10	2746	2755	80 %	0 %	20 %	0 %	414073196
62	NC_019430	A	6	6	2777	2782	100 %	0 %	0 %	0 %	414073196
63	NC_019430	TAA	2	6	2844	2849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073196
64	NC_019430	A	8	8	2858	2865	100 %	0 %	0 %	0 %	414073196
65	NC_019430	GAAA	2	8	2909	2916	75 %	0 %	25 %	0 %	414073196
66	NC_019430	CAA	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073196
67	NC_019430	ACAA	2	8	3029	3036	75 %	0 %	0 %	25 %	414073196
68	NC_019430	AAAGA	2	10	3058	3067	80 %	0 %	20 %	0 %	414073196
69	NC_019430	CAAA	2	8	3070	3077	75 %	0 %	0 %	25 %	414073196
70	NC_019430	AAC	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073196
71	NC_019430	CAAGAA	2	12	3238	3249	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	414073196
72	NC_019430	AAG	2	6	3278	3283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073196
73	NC_019430	TAAA	2	8	3308	3315	75 %	25 %	0 %	0 %	414073196
74	NC_019430	CAA	2	6	3463	3468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073196
75	NC_019430	CA	3	6	3479	3484	50 %	0 %	0 %	50 %	414073196
76	NC_019430	TGA	2	6	3527	3532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073196
77	NC_019430	AAG	2	6	3551	3556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073196
78	NC_019430	AAAG	2	8	3604	3611	75 %	0 %	25 %	0 %	414073196
79	NC_019430	CGA	2	6	3627	3632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073196
80	NC_019430	A	6	6	3637	3642	100 %	0 %	0 %	0 %	414073196
81	NC_019430	ATT	2	6	3701	3706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073196
82	NC_019430	AAC	2	6	3714	3719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073196
83	NC_019430	GAA	2	6	3817	3822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073196
84	NC_019430	AGT	2	6	3825	3830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073196
85	NC_019430	GATT	2	8	3831	3838	25 %	50 %	25 %	0 %	414073196
86	NC_019430	T	6	6	3837	3842	0 %	100 %	0 %	0 %	414073196
87	NC_019430	GCTT	2	8	3887	3894	0 %	50 %	25 %	25 %	414073196
88	NC_019430	AGA	2	6	3906	3911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073196
89	NC_019430	AC	3	6	3915	3920	50 %	0 %	0 %	50 %	414073196
90	NC_019430	AATG	2	8	3982	3989	50 %	25 %	25 %	0 %	414073196
91	NC_019430	GCAA	2	8	4019	4026	50 %	0 %	25 %	25 %	414073196
92	NC_019430	A	7	7	4085	4091	100 %	0 %	0 %	0 %	414073196
93	NC_019430	GAA	2	6	4096	4101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073196
94	NC_019430	A	7	7	4100	4106	100 %	0 %	0 %	0 %	414073196
95	NC_019430	CTA	2	6	4107	4112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073196
96	NC_019430	CAA	2	6	4116	4121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073196
97	NC_019430	AAT	2	6	4126	4131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073196
98	NC_019430	GAA	3	9	4218	4226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073196
99	NC_019430	TTC	2	6	4387	4392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073197
100	NC_019430	TA	3	6	4402	4407	50 %	50 %	0 %	0 %	414073197
101	NC_019430	CGT	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073197
102	NC_019430	TA	3	6	4549	4554	50 %	50 %	0 %	0 %	414073197
103	NC_019430	GCT	2	6	4665	4670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073197
104	NC_019430	TTTC	2	8	4682	4689	0 %	75 %	0 %	25 %	414073197
105	NC_019430	TCT	2	6	4810	4815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073197
106	NC_019430	GTA	2	6	4866	4871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073197
107	NC_019430	GTA	2	6	4940	4945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073197
108	NC_019430	AAT	2	6	4958	4963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073197
109	NC_019430	T	6	6	4970	4975	0 %	100 %	0 %	0 %	414073197
110	NC_019430	ACA	2	6	5471	5476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073198
111	NC_019430	AGTC	2	8	5477	5484	25 %	25 %	25 %	25 %	414073198
112	NC_019430	CAAAGG	2	12	5566	5577	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414073198
113	NC_019430	AT	3	6	5632	5637	50 %	50 %	0 %	0 %	414073198
114	NC_019430	TATT	2	8	5687	5694	25 %	75 %	0 %	0 %	414073198
115	NC_019430	AT	3	6	5740	5745	50 %	50 %	0 %	0 %	414073198
116	NC_019430	GCT	2	6	5747	5752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073198
117	NC_019430	CGAG	2	8	5795	5802	25 %	0 %	50 %	25 %	414073198
118	NC_019430	A	6	6	5810	5815	100 %	0 %	0 %	0 %	414073198
119	NC_019430	TTTA	2	8	5898	5905	25 %	75 %	0 %	0 %	414073198
120	NC_019430	GTC	2	6	5924	5929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414073198
121	NC_019430	TTA	2	6	5937	5942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073198
122	NC_019430	ATT	2	6	5962	5967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073198
123	NC_019430	GTT	2	6	5968	5973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073198
124	NC_019430	TGTT	2	8	6039	6046	0 %	75 %	25 %	0 %	414073198
125	NC_019430	G	6	6	6075	6080	0 %	0 %	100 %	0 %	414073198
126	NC_019430	TGG	2	6	6136	6141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073198
127	NC_019430	ATT	2	6	6170	6175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073198
128	NC_019430	GATGAA	2	12	6248	6259	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414073198
129	NC_019430	T	7	7	6316	6322	0 %	100 %	0 %	0 %	414073198
130	NC_019430	CAT	2	6	6384	6389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073198
131	NC_019430	TCT	2	6	6466	6471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073198
132	NC_019430	ATT	2	6	6478	6483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073198
133	NC_019430	ATTC	2	8	6559	6566	25 %	50 %	0 %	25 %	414073198
134	NC_019430	ATT	2	6	6641	6646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073198
135	NC_019430	CA	3	6	6674	6679	50 %	0 %	0 %	50 %	414073198
136	NC_019430	AAT	2	6	6698	6703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073198
137	NC_019430	TCT	2	6	6711	6716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073198
138	NC_019430	GGT	2	6	6739	6744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414073198
139	NC_019430	ATT	2	6	6748	6753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073198
140	NC_019430	ATG	2	6	6755	6760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073198
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269	NC_019430	ATT	2	6	18687	18692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414073205
270	NC_019430	CA	3	6	18696	18701	50 %	0 %	0 %	50 %	414073205
271	NC_019430	AAG	2	6	18778	18783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073205
272	NC_019430	CCT	2	6	18784	18789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073205
273	NC_019430	AAG	2	6	18850	18855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073205
274	NC_019430	AGGT	2	8	18873	18880	25 %	25 %	50 %	0 %	414073205
275	NC_019430	GTA	2	6	18913	18918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073205
276	NC_019430	CCA	2	6	18919	18924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414073205
277	NC_019430	TCA	2	6	18965	18970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073205
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279	NC_019430	AGAT	2	8	19096	19103	50 %	25 %	25 %	0 %	414073205
280	NC_019430	GA	3	6	19109	19114	50 %	0 %	50 %	0 %	414073205
281	NC_019430	ATTA	2	8	19165	19172	50 %	50 %	0 %	0 %	414073205
282	NC_019430	CTC	2	6	19178	19183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414073206
283	NC_019430	TGA	2	6	19204	19209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073206
284	NC_019430	TAA	2	6	19221	19226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414073206
285	NC_019430	TCA	2	6	19235	19240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073206
286	NC_019430	CAT	2	6	19257	19262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073206
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291	NC_019430	CAA	2	6	19445	19450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414073206
292	NC_019430	AG	3	6	19463	19468	50 %	0 %	50 %	0 %	414073206
293	NC_019430	TCTCT	2	10	19472	19481	0 %	60 %	0 %	40 %	414073206
294	NC_019430	TCA	2	6	19567	19572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073207
295	NC_019430	AGT	2	6	19587	19592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073207
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299	NC_019430	CAG	2	6	19802	19807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073207
300	NC_019430	TCA	2	6	19990	19995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073207
301	NC_019430	AAG	2	6	20011	20016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073207
302	NC_019430	TTG	2	6	20073	20078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414073207
303	NC_019430	CAT	2	6	20102	20107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073207
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305	NC_019430	AAG	3	9	20229	20237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414073207
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309	NC_019430	TCA	2	6	20320	20325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073207
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312	NC_019430	TCTGT	2	10	20477	20486	0 %	60 %	20 %	20 %	414073207
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341	NC_019430	GTAC	2	8	21838	21845	25 %	25 %	25 %	25 %	414073209
342	NC_019430	T	6	6	21956	21961	0 %	100 %	0 %	0 %	414073209
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363	NC_019430	TCGA	2	8	23516	23523	25 %	25 %	25 %	25 %	414073211
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381	NC_019430	GCA	2	6	25845	25850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073213
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390	NC_019430	T	6	6	26297	26302	0 %	100 %	0 %	0 %	414073213
391	NC_019430	TGA	2	6	26433	26438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414073213
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393	NC_019430	AGC	2	6	26492	26497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414073213
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395	NC_019430	ATC	2	6	26685	26690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414073213
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397	NC_019430	T	7	7	26825	26831	0 %	100 %	0 %	0 %	414073213
398	NC_019430	T	6	6	26862	26867	0 %	100 %	0 %	0 %	414073213
399	NC_019430	CTT	2	6	26902	26907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414073213
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